Kääpiösnautsereiden oma yhdistys perustettiin vuonna 1995 ja sen nimeksi tuli Suomen Kääpiösnautserikerho ry (SKSK). Suomen Kennelliitto myönsi yhdistykselle rotua harrastavan yhdistyksen oikeudet vuonna 2004.
Suomen Kennelliiton laatiman rotua harrastavan yhdistyksen ohjesäännön mukaan SKSK
*PEVISA on perinnöllisten vikojen ja sairauksien vastustamisohjelma. Rotu ei toistaiseksi kuulu PEVISAan.
SKSK:n toiminnasta vastaavat hallitus, jalostustoimikunta ja muut hallituksen tarpeen mukaan nimittämät toimikunnat. Hallitus valitaan syyskokouksessa, jolloin erovuorossa on puolet hallituksen kuudesta jäsenestä ja puheenjohtaja joka toinen vuosi. Kerhon jalostustoimikuntaan ehdotetaan jäseniä SKSK:n yleiskokouksessa. Kausi on kaksivuotinen. Kokoonpanon hyväksyy ensin Kääpiösnautserikerhon hallitus ja sen jälkeen rotujärjestön (SSPK) hallitus. Yhdistyksen sääntöihin voi tutustua yhdistyksen kotisivuilla www.kaapiosnautseri.fi.
SKSK alkoi julkaista omaa neljä kertaa vuodessa ilmestyvää Kääpiösnautserimme -nimistä jäsenlehteä vuonna 1996. Lisäksi SKSK julkaisee vuosittain tulosjulkaisun, joka käsittää mm. näyttely-, agility- ja koetulokset, rekisteröinnit, terveystutkimus- ja jalostustarkastustulokset sekä osan SKL:n KoiraNetistä saatavista tilastoista. Lisäksi tulosjulkaisussa on lista ja kuvat edellisenä vuonna Kennelliiton myöntämän tittelin saavuttaneista koirista.
Koska kääpiösnautsereiden rekisteröintimäärä ylittää vuosittain 500 kappaletta, on sekä keskusjärjestöllä että rotua harrastavalla Suomen Kääpiösnautserikerholla oikeus järjestää kaksi erikoisnäyttelyä vuosittain. Näihin erikoisnäyttelyihin osallistui vuonna 2007 yhteensä 410 kääpiösnautseria.
SKSK:n jäsenmäärä vuosina 1995-2007 on kehittynyt seuraavasti: vuoden 1996 lopussa jäseniä oli 151, vuoden 2000 lopussa 720 ja vuoden 2007 lopussa 1236. Jäsenmäärä on maltillisessa kasvussa.
Yhdistys järjestää jäsenilleen erilaista toimintaa. Vuosittain on järjestetty kääpiösnautseripäivä, jossa jalostustoimikunta on esitellyt edellisen vuoden tilastoja ja terveystilannetta. Siellä on myös pyritty sopimaan yhteisistä periaatteista rodun jalostuksessa. Jäsenille pyritään järjestämään vuosittain myös esim. kesäleiri, luentoja, trimmauskursseja, koulutuksia ja silmätarkastuksia. Vuonna 2004 kerhoon perustettiin koulutustoimikunta, joka toimii lähinnä pääkaupunkiseudulla.
Jalostustoimikunta käyttää tiedonkeruun ja jalostusneuvonnan työkaluina mm. pentuetiedustelukaavaketta, urostiedustelukaavaketta, astutusilmoituslomaketta sekä terveyskyselyä.
Yhdistyksellä oli käytössä vuosina 1999 – 2006 sitoumuskasvattajasopimus, joka lakkautettiin yleiskokouksen päätöksellä 25.2.2006. Sitoumuskasvattajasopimuksessa kasvattaja sitoutui noudattamaan jalostustyössään tiettyjä SKL:n kasvattajasopimusta tiukempia kriteerejä.